Αρκετές από τις φαρμακευτικές ουσίες που χρησιμοποιούνται κατά τη θεραπεία της υπογονιμότητας ενδέχεται να επιδράσουν στα συστήματα των νευροδιαβιβαστών, των χημικών αυτών ουσιών του εγκεφάλου που ευθύνονται για τη συναισθηματική ρύθμιση. Αν και λίγες μελέτες έχουν γίνει σχετικά, ο ακόλουθος πίνακας δίνει μια γενική ιδέα για τις ψυχολογικές επιδράσεις που μπορεί να προκαλέσει κάθε τέτοιου είδους φάρμακο.

Σε όποια περίπτωση, οι ψυχολογικές παρενέργειες των φαρμάκων της Ιατρικώς Υποβοηθούμενης Αναπαραγωγής συνίσταται να αντιμετωπίζονται με ψυχοθεραπεία, ενώ η χρήση φαρμακοθεραπείας, λόγω σύνδεσής της με περιπτώσεις αποβολών και δυσπλασιών, πρέπει να περιορίζεται σε εξαιρετικά σοβαρές ψυχικές διαταραχές